Esquema de disseny i solució de cadena peptídica polipeptídica

I. Resum
Els pèptids són macromolècules especials de manera que les seves seqüències són inusuals en les seves característiques químiques i físiques.Alguns pèptids són difícils de sintetitzar, mentre que altres són relativament fàcils de sintetitzar però difícils de purificar.El problema pràctic és que la majoria dels pèptids són lleugerament solubles en solucions aquoses, de manera que en la nostra purificació, la part corresponent del pèptid hidrofòbic s'ha de dissoldre en dissolvents no aquosos, per tant, és probable que aquests dissolvents o tampons siguin greument incompatibles amb l'ús. de procediments experimentals biològics, de manera que els tècnics tenen estrictament prohibit utilitzar el pèptid per als seus propis propòsits, de manera que els següents són diversos aspectes del disseny de pèptids per als investigadors.

Esquema de disseny i solució de cadena peptídica polipeptídica
En segon lloc, l'elecció correcta dels pèptids sintètics difícils
1. Longitud total de seqüències regulades a la baixa
Els pèptids de menys de 15 residus són més fàcils d'obtenir perquè la mida del pèptid augmenta i la puresa del producte brut disminueix.Com que la longitud total de la cadena peptídica augmenta més enllà dels 20 residus, la quantitat precisa del producte és una preocupació clau.En molts experiments, és fàcil obtenir efectes inesperats baixant el nombre de residus per sota de 20.
2. Disminuir el nombre de residus hidrofòbics
Els pèptids amb un gran predomini de residus hidrofòbics, especialment a la regió 7-12 residus de l'extrem C-terminal, solen causar dificultats sintètiques.Això es veu com una combinació inadequada precisament perquè s'obté un full de plec en B en la síntesi."En aquests casos, pot ser útil convertir més de dos residus positius i negatius, o posar Gly o Pro al pèptid per desbloquejar la composició del pèptid".
3. Regulació a la baixa de residus “difícils”.
"Hi ha una sèrie de residus Cys, Met, Arg i Try que generalment no es sintetitzen fàcilment".Ser normalment s'utilitzarà com una alternativa no oxidativa a Cys.
Esquema de disseny i solució de cadena peptídica polipeptídica

En tercer lloc, millorar l'elecció correcta del soluble en aigua
1. Ajusteu el terminal N o C
En relació amb els pèptids àcids (és a dir, carregats negativament a pH 7), es recomana especialment l'acetilació (acetilació N-terminal, C terminal sempre mantenint un grup carboxil lliure) per augmentar la càrrega negativa.Tanmateix, per als pèptids bàsics (és a dir, carregats positivament a pH 7), es recomana especialment l'aminació (grup amino lliure a l'extrem N i aminació a l'extrem C) per augmentar la càrrega positiva.

2. Escurçar o allargar molt la seqüència

Algunes de les seqüències contenen un gran nombre d'aminoàcids hidrofòbics, com ara Trp, Phe, Val, Ile, Leu, Met, Tyr i Ala, etc. Quan aquests residus hidrofòbics superen el 50%, normalment no són fàcils de dissoldre.Pot ser útil allargar la seqüència per augmentar encara més els pols positius i negatius del pèptid.La segona opció és regular a la baixa la mida de la cadena peptídica per augmentar els pols positius i negatius regulant a la baixa els residus hidrofòbics.Com més forts siguin els costats positius i negatius de la cadena peptídica, més probabilitats hi haurà de reaccionar amb l'aigua.
3. Poseu-hi un residu soluble en aigua
Per a algunes cadenes peptídiques, la combinació d'alguns aminoàcids positius i negatius pot millorar la solubilitat en aigua.La nostra empresa recomana que l'extrem N-terminal o C-terminal dels pèptids àcids es combinen amb Glu-Glu.Es va donar l'extrem N o C del pèptid bàsic i després Lys-Lys.Si el grup carregat no es pot col·locar, Ser-Gly-Ser també es pot col·locar al terminal N o C.Tanmateix, aquest enfocament no funciona quan els costats de la cadena peptídica no es poden canviar.