A la superfície, la formació d'enllaços peptídics, que produeixen dipèptids, és un procés químic senzill.Això vol dir que els dos components d'aminoàcids estan units per un enllaç peptídic, un enllaç amida, mentre es deshidraten.
La formació d'enllaços peptídics és l'activació d'un aminoàcid en condicions de reacció suau.(A) fragment carboxil, segon aminoàcid (B) El fragment carboxil activat nucleòfilment forma llavors el dipèptid (AB)."Si el component carboxil (A) no està protegit, no es pot controlar la formació de l'enllaç peptídic".Els subproductes com els pèptids lineals i cíclics es poden barrejar amb els compostos objectiu AB.Per tant, tots els grups funcionals no implicats en la formació d'enllaços peptídics s'han de protegir de manera temporalment reversible durant la síntesi de pèptids.
Per tant, la síntesi de pèptids, la formació de cada enllaç peptídic, implica tres passos d'agregació.
El primer pas és preparar alguns aminoàcids que necessiten protecció, i l'estructura zwitteriònica dels aminoàcids ja no existeix.
El segon pas és una reacció en dos passos per formar enllaços peptídics, en què el grup carboxil de l'aminoàcid protegit amb N s'activa primer a l'intermedi actiu i després es forma l'enllaç peptídic.Aquesta reacció acoblada pot ocórrer com a reacció d'un sol pas o com a dues reaccions seqüencials.
El tercer pas és l'eliminació selectiva o completa de la base protectora.Tot i que tota l'eliminació només es pot produir després d'haver reunit totes les cadenes peptídiques, també es requereix l'eliminació selectiva dels grups protectors per continuar la síntesi de pèptids.
Perquè 10 aminoàcids (Ser, Thr, Tyr, Asp, Glu, Lys, Arg, His, Sec i Cys) contenen grups funcionals de cadena lateral, que requereixen una protecció selectiva, fent que la síntesi de pèptids sigui més complicada.Cal distingir les bases de protecció temporal i semipermanent a causa dels diferents requisits de selectivitat.Els grups de protecció temporal s'utilitzen en el següent pas per reflectir la protecció temporal dels grups funcionals d'aminoàcids o carboxil.Els grups protectors semipermanents s'eliminen sense interferir amb els enllaços peptídics o les cadenes laterals d'aminoàcids ja formats, de vegades durant la síntesi.
"Idealment, l'activació del component carboxil i la posterior formació d'enllaços peptídics (reaccions d'acoblament) hauria de ser ràpida, sense formació racèmica o subproducte, i s'haurien d'aplicar reactius molars per aconseguir alts rendiments".Malauradament, cap dels mètodes d'acoblament químic compleix aquests requisits, i pocs són adequats per a la síntesi pràctica.
Durant la síntesi de pèptids, els grups funcionals implicats en diverses reaccions solen estar vinculats al centre manual, essent la glicina l'única excepció, i hi ha un risc potencial de rotació.
El pas final del cicle de síntesi de pèptids és l'eliminació de tots els grups protectors.L'eliminació selectiva dels grups protectors és important per a l'extensió de la cadena peptídica, a més del requisit per a l'eliminació completa de la protecció en la síntesi de dipèptids.Les estratègies sintètiques s'han de planificar acuradament.Depenent de l'elecció estratègica, N pot eliminar selectivament els grups protectors α-amino o carboxil.El terme "estratègia" es refereix a la seqüència de reaccions de condensació d'aminoàcids individuals.En general, hi ha una diferència entre la síntesi gradual i la condensació de fragments.La síntesi de pèptids (també coneguda com "síntesi convencional") té lloc en solució.En la majoria dels casos, l'allargament gradual de la cadena peptídica només es pot sintetitzar utilitzant la cadena peptídica per sintetitzar fragments més curts.Per sintetitzar pèptids més llargs, les molècules diana s'han de segmentar en fragments adequats i determinar que poden minimitzar el grau de diferenciació a l'extrem C terminal.Després que els fragments individuals s'agrupin gradualment, el compost objectiu s'unirà.L'estratègia de síntesi de pèptids inclou la selecció del fragment protector millor i més adequat, i l'estratègia de síntesi de pèptids inclou la selecció de la combinació més adequada de bases protectores i el millor mètode de conjugació de fragments.
Hora de publicació: 19-jul-2023