A sejtbe ható peptidek kis peptidek, amelyek könnyen behatolhatnak a sejtmembránba. Ez a molekulák osztálya, különösen a célzási funkciókkal rendelkező CPP -k, ígéretet tesznek a célsejtek hatékony átadása érdekében.
Ezért a kutatás bizonyos orvosbiológiai jelentőséggel bír. Ebben a tanulmányban a különböző transzmembrán aktivitással rendelkező CPP -ket szekvencia szinten vizsgálták, megpróbálták kideríteni a CPP -k transzmembrán aktivitását befolyásoló tényezőket, a CPP -k közötti szekvencia -különbségeket a különböző tevékenységekkel és a nem CPP -kkel, és bevezet egy módszert a biológiai szekvenciák elemzésére.
A CPPS és a nem CPPS szekvenciákat a CPPSITE adatbázisból és a különböző irodalomból szereztük be, és a transzmembrán peptideket (HCPPS, MCPPS, LCPP -k) magas, közepes és alacsony transzmembrán aktivitással extraháltuk a CPPS szekvenciákból, hogy adatkészleteket készítsenek. Ezen adatkészletek alapján a következő vizsgálatokat végezték:
Az 1. ábrán az ANOVA elemezte a különböző aktív CPP -k és nem CPP -k aminosav- és másodlagos szerkezeti összetételét. Megállapítottuk, hogy az aminosavak elektrosztatikus és hidrofób kölcsönhatása fontos szerepet játszott a CPP -k transzmembrán aktivitásában, és a spirális szerkezet és a véletlenszerű tekercsek szintén befolyásolták a CPP -k transzmembrán aktivitását.
2. A kétdimenziós síkon a CPP-k fizikai és kémiai tulajdonságait és hosszát mutatták be. Megállapítást nyert, hogy a CPP -k és a különböző tevékenységekkel rendelkező nem CPP -k bizonyos speciális tulajdonságokba csoportosíthatók, és a HCPPS, az MCPPS, az LCPP -k és a nem CPPS három klaszterre oszthatók, amelyek megmutatják azok különbségeit;
3. Ebben a cikkben bevezetik a biológiai szekvencia fizikai és kémiai centrid fogalmát, és a szekvenciát alkotó maradványokat részecskepontoknak tekintik, és a szekvenciát kivonják a kutatás részecskendszerének. Ezt a módszert alkalmazták a CPPS elemzésére azáltal, hogy a CPP -ket különböző tevékenységekkel a 3D síkra PCA módszerrel vetítették ki, és azt találtuk, hogy a legtöbb CPP összeállt, és néhány LCPP -t a nem CPP -kkel együtt csoportosítva.
Ez a tanulmány kihatással van a CPP -k megtervezésére és a CPP -k szekvenciáinak különbségeinek megértésére a különböző tevékenységekkel. Ezenkívül az ebben a cikkben bevezetett biológiai szekvenciák fizikai és kémiai centrid elemzési módszere más biológiai problémák elemzésére is alkalmazható. Ugyanakkor felhasználhatók bemeneti paraméterekként bizonyos biológiai osztályozási problémákhoz, és szerepet játszanak a mintázatfelismerésben.
A postai idő: 2025-07-02